La asignatura se basa en el texto:
Biological Physics: Energy, Informatión,
Life, de Philip Nelson
Visite la página web del libro:
http://www.whfreeman.com/biologicalphysics
y la del autor:
http://www.physics.upenn.edu/
Hay traducción al español del libro en la editorial Reverté.
También es interesante el artículo de Nelson:
Teaching Biological Physics Physics Today 58:3 46 (March 2005).
También recomiendo el texto
Physical Biology of the Cell. de Rob Phillips, Jane Kondev, Julie Theriot (Garland 2009).
Ambos se pueden encontrar en la Biblioteca de Ciencias.
EVALUACIÓN
La evaluación del curso se basará en 4 apartados
- Ejercicio escrito (20%).
- Resolución y discusión de los problemas y casos propuestos (30%).
- Preparación de un tema avanzado como trabajo de curso (30%).
- Presentación oral del trabajo de curso (20%)
TRABAJOS DE CURSO.
Algunos ejemplos de Trabajos de Curso ofertados en los últimos cursos son:
- El problema de Plegamiento de Proteínas.
- Bacterias magnetotactiles.
- Transmisión de señales a través de membranas. Neuronas.
- Redes Neuronales.
- Transducción en el oido medio.
- Modelización Fisica de la ATPasa.
- Física del empaquetamiento del DNA en virus.
- Experimento de Luria-Delbrück.
- .....
TRANSPARENCIAS DEL CURSO
(según el esquema del libro de P. Nelson)
INTRODUCCIÓN Y CAPITULO1 ("LO QUE SABÍAN LOS ANTIGUOS")
CAPITULO 2 ("QUÉ HAY EN EL INTERIOR DE LA CELULA")
Excursión: Simulación de biomoléculas.
CAPITULO 3 ("EL BAILE MOLECULAR")
Excursión: Lección sobre la herencia.
CAPITULO 4 ("CAMINATAS ALEATORIAS, FRICCIÓN Y DIFUSIÓN")
CAPÍTULO 5 ("LA VIDA EN LA VIA LENTA: EL MUNDO A BAJO NÚMERO DE REYNOLDS")
CAPÍTULO 6 ("ENTROPÍA, TEMPERATURA Y ENERGÍA LIBRE").
APLICACIÓN: Propiedades mecánicas del ADN.
CAPÍTULO 7 ("FUERZAS ENTRÓPICAS EN ACCIÓN ")
CAPÍTULO 8 ("FUERZAS QUÍMICAS Y AUTOENSAMBLAJE")
APLICACIÓN: Mecánica Estadística de la unión receptor-ligando.
APLICACIÓN: Dinámica de Motores moleculares.
CAPÍTULO 9 ("INTRODUCCIÓN A LA BIOLOGÍA DE SISTEMAS ")
LINKS ÚTILES (o no ) PARA LA ASIGNATURA.
Protein Data Bank (Base de datos de estructura de moléculas biológicas)
BioNumbers (Base de datos sobre números útiles en biología)
Rasmol (visualizador de moléculas)
vmd (Visual Molecular Dynamics)
Water Structure and Science
Biological Physics at IOP
Athene Donald's Blog
Molecular Movies (una colección de animaciones de biología, utilizo alguna durante el curso).
Division of Biological Physics (APS)
